Søens overflade areal er 3987 ha. – dens maximale dybde er 5,6 m. og har en gennemsnits dybde på 3,07 m.

Mange områder af søen er freder på forskellig – dette er bla. af hensyn til rastende stor skallesluger og fiskeørn samt ynglende havørn, rørhøg og rørdrum, og andre fuglearter som både yngler eller raster omkring søen.

Fisk i Arresø
Der er registreret ca. 17 fiskearter: skalle, brasen, sandart, aborre, hork, ål, gedde, løje, rimte, rudskalle, tre- og nipigget hundestejle, flire, regnløje, karusse. suder, brasenskalle. Dette er en del over gennemsnittet for danske søer.

Vandet i Arresø
Vandet i Arresø er forurenet i en grad, som gør det uegnet til badning. Denne forurening tog fart i start 1900-tallet, da Hillerød i 1920’erne blev kloakeret og ledte urenset spildevand via Pøleå ud i Arresø. Mængden af spildevand steg drastisk, da de moderne vandskyllende toiletter kom. Den stigende industrialisering var også en væsentlig faktor i forureningen. I start 1950’erne gik det helt galt. Søen modtog nu også spildevand fra omegnskommunerne Helsinge, Frederiksværk og Skævinge, hvorpå Arresø blev en af landets mest forurenede søer. I dag ledes spildevandet til renseanlæg, og der er genskabt mange småsøer i oplandet som gør at Arresø får tilført langt mindre mængder næringsstoffer sammenlignet med tidligere.