I søen findes der nøkkeroser og åkander i flere farver, hvide, pink og lysegule, hvilket formentlig er grunden til at Gråmyr tidligere blev kaldet Åkandesøen. Man plantede nøkkeroserne for at pynt i den vandfyldte lergrav, der var opstået i kølvandet på lergravningen i 1883. Nøkkeroserne bredte sig med tiden så meget – og var skyld i (med Sump-Padderok) at man i 2013 foretog en total oprensning af søen, og igen i 2019 – sidst dog primært pga. en udbredelse af den invasive krebseklo en vandplante, som faktisk var blevet genudsatte i forbindelse med oprensingen i 2013 – i håb på at kunne tiltrække de sjældne grønne mosaikguldsmede til området.

I og ved Gråmyr vokser der også svømmende vandaks, hvide vandranunkler og den kødædende blærerod med gule blomster, samt langs med bredden den smukke plante brudelys med fine rosa blomster.

Rundt i Gudhjem Plantage er der flere Bautasten – Hestenene.