Oprindeligt blev havnen anlagt i 1891, hvorfra man begyndte at udskibe granit fra Hammerværket – dette stoppede i 1974. Inden Hammerhavn brugte man området til anløbssted for Hammershus.

I 2012 blev der opført 3 mindre træhuse på Hammerhavn.  Disse blev opført i et projekt *Mulighedernes Land* på Bornholm. Et projekt mellem Realdania og Bornholms Regionskommune. Disse huse skulle give bedre muligheder for havnens gæster og tilføre mere liv. Her er en kiosk, et fælleshus for foreninger samt en servicebygning. Designet på husene er meget karakteristiske. De har spidse og skæve tage, som refererer til de nærliggende højdedrag, nemlig Hammerknuden og Hammershus.

I 2012 forsøgte man at genskabe meget af det oprindelige havneanlæg for synliggøre og sikre noget af Bornholms granithistorie.
Ved havnen er der en lille sandstrand med en badebro. Herfra kan man i små både opleve klippekysten nedenfor Hammershus. På turen, der er bedst at opleve i fhv. stille vejr, kan man sejle ind i den smalle klippehule – Våde Ovn.

Gæstesejlere kan lægge til på ledige pladser i inderhavnen og ellers i yderbassinet.