Lystbådene kan sejle ind i det sydøstlige bassin. Det første bassin er oftest reserveret til Christiansøfartens færge Ertholmene. Der er fra Gudhjem 1 eller flere afgange til Christiansø herfra.

I dette område ligger også turbåden Thor. Denne tilbyder guidede ture til Helligdomsklipperne og Bornholms kunstmuseum.

Der er oftest plads til lystbåde i havnen. Dog reduceres kapaciteten ved pålandsvind, hvorpå den gamle egetræs havneport mellem inder- og yderbassin lukkes. I havnen er der bade- og toiletfaciliteter, samt vaskeri til gæstesejlere. Byens turistinformation ligger på kajen og servicerer også gerne gæstesejlere.

I sommerperioden kl 10 om formiddagen bliver stemningen på havnen intens. Her synges dagens sange samtidig med første afgang mod Christiansø. Man kan bestige klipperne omkring havnen. Herfra kan man nyde udsigten over Gudhjem by og havn.